截止2006年1月，FSC认可了15家认证机构，分别是：
（1）美国科学认证体系森林保护计划（Scientific Certification Systems Forest Conservation Program），简称SCS；
（2）美国非政府组织雨林联盟精明木材认证计划（Rainforest Alliance Smart Wood Program），简称SmartWood或SW；
（3）英国非政府组织土壤协会木材标签计划（Soil Association Woodmark Scheme），简称SA；
（4）英国SGS公司；
（5）英国的BM TRADA认证有限公司，简称TT；
（6）德国农业技术咨询公司Terra体系，简称GFA；
（7）意大利的Certiquality；
（8）瑞士的IMO；
（9）荷兰的SKAL；
（10）加拿大的KPMG森林认证服务公司，简称KPMG；
（11）瑞士质量和管理体系协会（SQS）；
（12）法国的CTBA；
（13）法国的EUROCERTIFOR，简称EUR；
（14）意大利的ICILA；
（15）墨西哥的VIBO。
另外，曾经认可的认证机构加拿大的SFF和南非的SABS被暂停或吊销了认证资格。还有4个国家的4个认证机构向FSC提出了申请。
